La JMJ de Cracovia 2016 ya tiene su logotipo. Es éste. Tiene tres colores: azul, rojo y amarillo, los tres colores de la ciudad de Cracovia.

Está enmarcado en un recuadro rojo que representa el mapa de Polonia. En el centro, en amarillo, hay un punto que es la ciudad de Cracovia. La protagonista es la cruz, que representa a Jesucristo. La luz de la Divina Misericordia sale de ella en azul y rojo, los colores de la pintura "Jesús confío en ti". Está además relacionado con el lema del evento: "Bienaventurados los misericordiosos".